AT3G46330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
maternal effect embryo arrest 39 (MEE39); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT3G46400.1); Has 157192 Blast hits to 122633 proteins in 4636 species: Archae - 101; Bacteria - 13531; Metazoa - 44718; Fungi - 9899; Plants - 69914; Viruses - 393; Other Eukaryotes - 18636 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17020887..17024884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 98683.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 878 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKNLCWVFLS LFWFGVFLII RFAEGQNQEG FISLDCGLPL NEPPYIESET GIQFSSDENF IQSGKTGRIP KNLESENLKQ YATLRYFPDG IRNCYDLRVE 101: EGRNYLIRAT FFYGNFDGLN VSPEFDMHIG PNKWTTIDLQ IVPDGTVKEI IHIPRSNSLQ ICLVKTGATI PMISALELRP LANDTYIAKS GSLKYYFRMY 201: LSNATVLLRY PKDVYDRSWV PYIQPEWNQI STTSNVSNKN HYDPPQVALK MAATPTNLDA ALTMVWRLEN PDDQIYLYMH FSEIQVLKAN DTREFDIILN 301: GETINTRGVT PKYLEIMTWL TTNPRQCNGG ICRMQLTKTQ KSTLPPLLNA FEVYSVLQLP QSQTNEIEVV AIKNIRTTYG LSRISWQGDP CVPKQFLWDG 401: LNCNITDISA PPRIISLNLS SSGLSGTIVS NFQNLAHLES LDLSNNSLSG IVPEFLATMK SLLVINLSGN KLSGAIPQAL RDREREGLKL NVLGNKELCL 501: SSTCIDKPKK KVAVKVVAPV ASIAAIVVVI LLFVFKKKMS SRNKPEPWIK TKKKRFTYSE VMEMTKNLQR PLGEGGFGVV YHGDLNGSEQ VAVKLLSQTS 601: AQGYKEFKAE VELLLRVHHI NLVNLVGYCD EQDHFALIYE YMSNGDLHQH LSGKHGGSVL NWGTRLQIAI EAALGLEYLH TGCKPAMVHR DVKSTNILLD 701: EEFKAKIADF GLSRSFQVGG DQSQVSTVVA GTLGYLDPEY YLTSELSEKS DVYSFGILLL EIITNQRVID QTRENPNIAE WVTFVIKKGD TSQIVDPKLH 801: GNYDTHSVWR ALEVAMSCAN PSSVKRPNMS QVIINLKECL ASENTRISRN NQNMDSGHSS DQLNVTVTFD TDVKPKAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)