AT4G31100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall-associated kinase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
wall-associated kinase, putative; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Wall-associated kinase family protein (TAIR:AT4G31110.1); Has 122281 Blast hits to 119494 proteins in 4412 species: Archae - 129; Bacteria - 13513; Metazoa - 46678; Fungi - 10143; Plants - 33595; Viruses - 489; Other Eukaryotes - 17734 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15123862..15126426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87309.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 786 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYKNTNNSH LILFKLLLLL ILYSADLTAS SSCRSECGGC KCGGIAIPYP FGIGKGCYLE KSYEIECLNT SGKLVPFLSV ISKEVVSIHL PGRQSFGSVR 101: VRSPITSAGC SSDGKDSAPV MNLTDSPFFV SDINNLVGVG CSSKVSLEHI KQNMVGCELN CSTTNASDSN SIPFFDKTGC SFSYTFAQVC TGNKPEDMGC 201: DGRGCCQASL PREPQQVIGI RIESNDGKST TSGDCRVAFL TDEFFSLSKL TKPEQLHAKR YATLSLGWIM QTRNTSFVNS LACKIRKDTD TAYSNDQSIK 301: CICDYTMSII SDIRYANCEC NLGYKGNPYD SDGCRDIDEC KENPKYCKET DTCVNFEGGY RCVGDKTKAI MIGAGTGFGV LVLVGGVWWL RKFLVKRRMA 401: KRKKKFFKRN GGLLLQQELN TRQGVVEKAR IFTSKELEKA TENFSENRVL GHGGQGTVYK GMLVDGRTVA VKKSKVIDED KLQEFINEVV ILSQINHRHV 501: VKLLGCCLET EVPILVYEFI INGNLFKHIH EEEADDYTMI WGMRLRIAVD IAGALSYLHS AASSPIYHRD IKSTNILLDE KYRAKVADFG TSRSVTIDQT 601: HWTTVISGTV GYVDPEYYRS SQYTEKSDVY SFGVILAELI TGDKPVIMVQ NTQEIIALAE HFRVAMKERR LSDIMDARIR DDSKPEQVMA VANLAMKCLS 701: SRGRNRPNMR EVFTELERIC TSPEDSQVQN RIDEEEEEDG VEEEEEVVTI VHRGDSWSIG VTAPASSIVA SPPSSDVEPL NPLLTW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)