AT4G31110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Wall-associated kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Wall-associated kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall-associated kinase, putative (TAIR:AT4G31100.1); Has 121460 Blast hits to 119275 proteins in 4421 species: Archae - 129; Bacteria - 13486; Metazoa - 45601; Fungi - 10420; Plants - 33407; Viruses - 489; Other Eukaryotes - 17928 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15127257..15129880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 88758.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 793 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNESTNCSF FLNLFMLLLL LIFYSADACQ RECGGISIPY PFGIGKDCCL EKYYEIECRN TTSRKLVPLL SFINKEVVSI SLPSADSHFA YEVSDQERHE 101: SFGLVRVKFP ITSAGCFNDG KESGGGSKMN FTGSPFFIDR SNSLIAAGCN SKVSLMYIKP KMVGCELSCN TSKDSYSNSI PFVEAGCSSN VLPYSQDQGC 201: PEEIAEETGC NGIGCCQASL PNEPQQVIGI RTENNDGNST TKVECTVSAF LTDEIYALPK ATKTEHLLAK RYATVSLGWV IQTSNRSFLD SLALACKDRE 301: DYRNTTNLER KCTCGRITIS ETSYANCGCT YGYTGNPYVL NGCKDIDECK VKFEYCGKTE TCVNFEGGYR CVRDKTKAIM IGAGTGFGVL VLVGGLWWLR 401: KFLIKRRITK RKKKFFKRNG GLLLLQELNT REGYVEKTRV FNSRELEKAT ENFSENRVLG HGGQGTVYKG MLVDGRTVAV KKSKVIDEDK LQEFINEVVI 501: LSQINHRHVV KLLGCCLETE VPMLVYEFII NGNLFKHIHE EESDDYTMLW GMRLRIAVDI AGALSYLHSS ASSPIYHRDI KSTNILLDEK YRAKVADFGT 601: SRSVTIDQTH WTTVISGTVG YVDPEYYQSS QYTEKSDVYS FGVILAELIT GDKPVIMVQN TQEIVALAEH FRVAMKEKRL TDIIDARIRN DCKPEQVMAV 701: AKVAMKCLSS KGKKRPNMRE VFTELERICT SPEDSQVHNR IDEEEEEEEE EEEVVTTINR GDSWSISVTA PALSIVASSP SSDVEPLFPR LTW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)