AT4G01370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a nuclear and cytoplasmically localized MAP kinase involved in mediating responses to pathogens. Its substrates include MKS1 and probably MAP65-1.The MAP65-1 interaction is involved in mediating cortical microtuble organization. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 4 (MPK4); FUNCTIONS IN: MAP kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: in 14 processes; LOCATED IN: nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), JNK MAP kinase (InterPro:IPR008351), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 11 (TAIR:AT1G01560.2); Has 123445 Blast hits to 122024 proteins in 4656 species: Archae - 100; Bacteria - 13145; Metazoa - 47072; Fungi - 12439; Plants - 29862; Viruses - 477; Other Eukaryotes - 20350 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:567219..568889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42854.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 376 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAESCFGSS GDQSSSKGVA THGGSYVQYN VYGNLFEVSR KYVPPLRPIG RGAYGIVCAA TNSETGEEVA IKKIGNAFDN IIDAKRTLRE IKLLKHMDHE 101: NVIAVKDIIK PPQRENFNDV YIVYELMDTD LHQIIRSNQP LTDDHCRFFL YQLLRGLKYV HSANVLHRDL KPSNLLLNAN CDLKLGDFGL ARTKSETDFM 201: TEYVVTRWYR APELLLNCSE YTAAIDIWSV GCILGETMTR EPLFPGKDYV HQLRLITELI GSPDDSSLGF LRSDNARRYV RQLPQYPRQN FAARFPNMSA 301: GAVDLLEKML VFDPSRRITV DEALCHPYLA PLHDINEEPV CVRPFNFDFE QPTLTEENIK ELIYRETVKF NPQDSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)