AT1G31220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Formyl transferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
N10-formyltetrahydrofolate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase that catalyzes the conversion of phosphoribosyl glycineamide to phosphoribosyl N-formylglycineamide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Formyl transferase; FUNCTIONS IN: hydroxymethyl-, formyl- and related transferase activity, phosphoribosylglycinamide formyltransferase activity, formyltetrahydrofolate deformylase activity; INVOLVED IN: purine ribonucleotide biosynthetic process, biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosylglycinamide formyltransferase, active site (InterPro:IPR001555), Phosphoribosylglycinamide formyltransferase (InterPro:IPR004607), Formyl transferase, N-terminal (InterPro:IPR002376); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Formyl transferase (TAIR:AT4G17360.1); Has 13846 Blast hits to 13846 proteins in 2648 species: Archae - 117; Bacteria - 9929; Metazoa - 318; Fungi - 202; Plants - 129; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 3148 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11157064..11158408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32171.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 292 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESRVLFSSQ FNFPVNSPFK TRETSIAPLT PSRNVLSFSF RSPAERCAMR IVPLVKAASS TPQIVAEVDG SSHEPRRKKL AVFVSGGGSN FRKIHEGCSD 101: GSVNGDVVLL VTNKKDCGGA EYARSNGIPV LVFPKAKREP SDGLSPSELV DVLRKYGVDF VLLAGYLKLI PVELVQAFPK RILNIHPALL PAFGGKGLYG 201: IKVHKAVLES GARYSGPTIH FVNEEYDTGR ILAQSAVRVI ANDTPEELAK RVLHEEHKLY VEVVGAICEE RIKWREDGVP LIQNKQNPDE YY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)