AT4G00970.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 41 (CRK41); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 29 (TAIR:AT4G21410.1); Has 118247 Blast hits to 116820 proteins in 4488 species: Archae - 94; Bacteria - 12773; Metazoa - 43795; Fungi - 10171; Plants - 33437; Viruses - 407; Other Eukaryotes - 17570 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:418437..421694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74891.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 665 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSSCSLSRP QHLFFFFFLF VPFLSLGQQI SVDINSAIWE FPSNPLCLSQ QSNFAKSSQF SKNLDSLVSS IPSLKSNTYN FYSLSVGSIS DQERVEAIGI 101: CNRVVNRVDC LNCIAQAAVN LTTMYCPQHR GAYVRATKCM FRYSDKPIFG KLETSPVLEA PNPSNATGDR NEFIRLQSEL LNRLRSMAAS GGSKRKYAQG 201: TDPGSPPYTT FFGAVQCTPD LSEKDCNDCL SYGFSNATKG RVGIRWFCPS CNFQIESDLR FFLLDSEYEP DPKPGNDKVK IIIATVCSVI GFAIIAVFLY 301: FFMTRNRRTA KQRHEGKDLE ELMIKDAQLL QLDFDTIRLA TNDFSRDNQL GEGGFGAVYK GVLDYGEEIA VKRLSMKSGQ GDNEFINEVS LVAKLQHRNL 401: VRLLGFCLQG EERILIYEFF KNTSLDHYIF DSNRRMILDW ETRYRIISGV ARGLLYLHED SRFKIVHRDM KASNVLLDDA MNPKIADFGM AKLFDTDQTS 501: QTRFTSKVAG TYGYMAPEYA MSGEFSVKTD VFSFGVLVLE IIKGKKNNWS PEEDSSLFLL SYVWKSWREG EVLNIVDPSL VETIGVSDEI MKCIHIGLLC 601: VQENAESRPT MASVVVMLNA NSFTLPRPSQ PAFYSGDGES LSRDKNQINH IASLNDVTIT EFDAR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)