AT4G23220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 14 (CRK14); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 12 (TAIR:AT4G23200.1); Has 123017 Blast hits to 121427 proteins in 4536 species: Archae - 96; Bacteria - 13930; Metazoa - 45424; Fungi - 10107; Plants - 35087; Viruses - 455; Other Eukaryotes - 17918 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12154091..12157091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82196.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 728 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFEFVYDVLL DSTEIVNEST EILICLLMVH TPHNFFFFFF FDKGDRQKKV CILFILTCCP NVNIICTILK MELKNLFPIF WFVLVGFAVV SAQECGKTGF 101: FVPQSRYETN RGLLLSSLPS NVSARGGFYN SSIGQGPDRV YALGMCIEGA EPDVCSDCIE YASNLLLDTC LNQTEGLAWP EKRILCMVRY SNSSFFGSLK 201: AEPHFYIHNV DDITSNLTEF DQVWEELARR MIASTTSPSS KRKYYAADVA ALTAFQIIYA LMQCTPDLSL EDCHICLRQS VGDYETCCNG KQGGIVYRAS 301: CVFRWELFPF SEAFSRISLA PPPQSPAFPT LPAVTNTATK KGSITISIGI VWAIIIPTVI VVFLVLLALG FVVYRRRKSY QGSSTDITIT HSLQFDFKAI 401: EDATNKFSES NIIGRGGFGE VFMGVLNGTE VAIKRLSKAS RQGAREFKNE VVVVAKLHHR NLVKLLGFCL EGEEKILVYE FVPNKSLDYF LFDPTKQGQL 501: DWTKRYNIIR GITRGILYLH QDSRLTIIHR DLKASNILLD ADMNPKIADF GMARIFGIDQ SGANTKKIAG TRGYMPPEYV RQGQFSTRSD VYSFGVLVLE 601: IICGRNNRFI HQSDTTVENL VTYAWRLWRN DSPLELVDPT ISENCETEEV TRCIHIALLC VQHNPTDRPS LSTINMMLIN NSYVLPDPQQ PGFFFPIISN 701: QERDGLDSMN RSNPQTINDV TITDFEPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)