AT3G55050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein phosphatase 2C family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein phosphatase 2C family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation; LOCATED IN: protein serine/threonine phosphatase complex; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein phosphatase 2C family protein (TAIR:AT3G12620.2); Has 5454 Blast hits to 5450 proteins in 305 species: Archae - 0; Bacteria - 58; Metazoa - 1459; Fungi - 575; Plants - 2427; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 935 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20400669..20401922 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42853.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 384 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSTTFRRIV SPCWRPFGIG EDSSPGSDDT NGRLDGLLWY KDSGNHITGE FSMAVVQANN LLEDHSQLES GPISLHESGP EATFVGVYDG HGGPEAARFV 101: NDRLFYNIKR YTSEQRGMSP DVITRGFVAT EEEFLGLVQE QWKTKPQIAS VGACCLVGIV CNGLLYVANA GDSRVVLGKV ANPFKELKAV QLSTEHNASI 201: ESVREELRLL HPDDPNIVVL KHKVWRVKGI IQVSRSIGDA YLKRAEFNQE PLLPKFRVPE RFEKPIMRAE PTITVHKIHP EDQFLIFASD GLWEHLSNQE 301: AVDIVNSCPR NGVARKLVKA ALQEAAKKRE MRYSDLEKIE RGIRRHFHDD ITVIVVFLHA TNFATRTPIS VKGGGLLSAH NPVL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)