AT3G10620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 26 (NUDX26); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase (InterPro:IPR020476), NUDIX hydrolase, conserved site (InterPro:IPR020084), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 27 (TAIR:AT5G06340.1); Has 4741 Blast hits to 4739 proteins in 1213 species: Archae - 2; Bacteria - 2928; Metazoa - 13; Fungi - 1; Plants - 97; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1700 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3320263..3321565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24618.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 216 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALYRPLLLH HPTSPSVTTF LRNYPSKPIK FSSLPFLHRC RKSRVSSSSA RCCSSMESPP EGYRRNVGVC LMNSSKKIFT ASRLDIPSAW QMPQGGIDEG 101: EDPRVAVMRE LKEETGVHSA EILAEAPHWI TYDFPPDVRE KLKVRWGSDW KGQAQKWFLL KFTGKDEEIN LLGDGTEKPE FGEWSWTSPD QVVENAVEFK 201: KPVYKEVMSA FASHLQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)