AT3G10200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.914 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT5G04060.1); Has 1192 Blast hits to 1180 proteins in 187 species: Archae - 1; Bacteria - 301; Metazoa - 2; Fungi - 2; Plants - 876; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 10 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3157618..3160016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67651.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 591 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGSVIGAER SGQTIMVALV LMVGSFYTGS LFGTNQPIYV SHPSSHSASS KFANKIELTY RRLPLVIPES GMNVCPLEFN EYIPCHNVTY VHQLLPSLNL 101: SRREDLERHC PPLEHRLFCL VPPPNDYKIP IRWPTSRDYV WRSNVNHTHL AQVKGGQNWV HEQGQFWWFP GGGTHFKHGA AEYIQRLGNM MTNETGDLRS 201: AGVVQVLDVG CGVASFAAYL LPLGIQTISF APKDGHENQI QFALERGIGA MISAVATKQL PYPAASFEMV HCSRCRVDWH TNDGILLKEV HRLLRPNGFF 301: VYSSPPAYRK DKEYPMIWDK LVNLTSAMCW KLISRKVQTA IWIKEEKEVC LKQKAELKLI SLCDVEDVLK PSWKVPLKDC VQISGQTEER PSSLAERLSA 401: YPATLRKIGI SEDEYTSDTV FWREQVNHYW RLMNVNETEV RNVMDMNAFI GGFAAAMNSY PVWVMNIVPA TMNDTLSGIF ERGLNGAFHD WCEAFSTYPR 501: TYDLVHSDHV FSHYNKSYGD GCLLEDIMLE MDRIVRPQGF VIIRDEEYII SRIRGLAPKF LWEVETHELE NKDKKITESV LFCRKRFWAI I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)