AT5G51020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : crumpled leaf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes CRL (CRUMPLED LEAF), a protein localized in the outer envelope membrane of plastids. Mutation in this gene affects the pattern of cell division, cell differentiation and plastid division. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CRUMPLED LEAF (CRL); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1001 (InterPro:IPR010404); Has 109 Blast hits to 109 proteins in 37 species: Archae - 0; Bacteria - 64; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 31; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:20745560..20747165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30331.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 269 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTESGSDPE SSSNGWSRAR GLVVKTLVLI GGALLIKRLT KSTTRRDHAR VVSRSLTGEK FTREQASRDP DNYFNIRMLS CPAAEMVDGS EVLYLEQAFW 101: RTPQKPFRQR LYMVKPCPKE LKCDVEVSSY AIRDAEEYKN FCDRPKDQRP LPEEVIGDIG EHLTTIHLNC CDRGKRCLYE GSTSPGGFPN SWNGASYCTS 201: DLAVLKNNEI HLWDRGFDEN RNQVWGPKEG PYEFKPATSS SINENLSALN ILYQSSIDKP IQGSLILQD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)