AT5G47030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the mitochondrial ATP synthase subunit delta. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transporting ATP synthase activity, rotational mechanism, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex, mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1); EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit, N-terminal (InterPro:IPR020546), ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit (InterPro:IPR001469); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:19090384..19092034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21548.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 203 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFKQASRLLS RSVAAASSKS VTTRAFSTEL PSTLDSTFVE AWKKVAPNMD PPQTPSAFMK PRPSTPSSIP TKLTVNFVLP YTSELTGKEV DMVIIPASTG 101: QMGVLPGHVP TIAELKPGIM SVHEGTDVKK YFLSSGFAFL HANSVADIIA VEAVPLDHID PSQVQKGLAE FQQKLASATT DLEKAEAQIG VEVHSAINAA 201: LSG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)