AT2G07727.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Di-haem cytochrome, transmembrane;Cytochrome b/b6, C-terminal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Di-haem cytochrome, transmembrane;Cytochrome b/b6, C-terminal; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, oxidoreductase activity; INVOLVED IN: respiratory electron transport chain; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b/b6, C-terminal (InterPro:IPR005798), Cytochrome b/b6 (InterPro:IPR016175), Di-haem cytochrome, transmembrane (InterPro:IPR016174), Cytochrome b/b6, N-terminal (InterPro:IPR005797); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: apocytochrome b (TAIR:ATMG00220.1); Has 180948 Blast hits to 180662 proteins in 32826 species: Archae - 150; Bacteria - 2756; Metazoa - 167905; Fungi - 1359; Plants - 1860; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6918 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:3450863..3452044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44149.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGP LAGICLVIQI VTGVFLAMHY TPHVDLAFNS VEHIMRDVEG GWLLRYMHAN GASMFLIVVY 101: LHIFRGLYHA SYSSPREFVW CLGVVIFLLM IVTAFIGYVL PWGQMSFWGA TVITSLASAI PVVGDTIVTW LWGGFSVDNA TLNRFFSLHH LLPFILVGAS 201: LLHLAALHQY GSNNPLGVHS EMDKIAFYPY FYVKDLVGWV AFAIFFSIWI FYAPNVLGHP DNYIPANPMS TPPHIVPEWY FLPIHAILRS IPDKAGGVAA 301: IAPVFICLLA LPFFKSMYVR SSSFRPIHQG MFWLLLADCL LLGWIGCQPV EAPFVTIGQI SPLVFFLFFA ITPILGRVGR GIPNSYTDET DHT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)