AT3G21340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT1G51850.1); Has 160620 Blast hits to 122303 proteins in 4467 species: Archae - 99; Bacteria - 13621; Metazoa - 44084; Fungi - 10001; Plants - 73653; Viruses - 414; Other Eukaryotes - 18748 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7511848..7515937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 100200.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 899 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEYHPQAIRL CALIFISFYA LLHLVEAQDQ KGFISLDCGS LPNEPPYNDP STGLTYSTDD GFVQSGKTGR IQKAFESIFS KPSLKLRYFP DGFRNCYTLN 101: VTQDTNYLIK AVFVYGNYDG LNNPPSFDLY LGPNLWVTVD MNGRTNGTIQ EIIHKTISKS LQVCLVKTGT SSPMINTLEL RPLKNNTYNT QSGSLKYFFR 201: YYFSGSGQNI RYPDDVNDRK WYPFFDAKEW TELTTNLNIN SSNGYAPPEV VMASASTPIS TFGTWNFSWL LPSSTTQFYV YMHFAEIQTL RSLDTREFKV 301: TLNGKLAYER YSPKTLATET IFYSTPQQCE DGTCLLELTK TPKSTLPPLM NALEVFTVID FPQMETNPDD VAAIKSIQST YGLSKISWQG DPCVPKQFLW 401: EGLNCNNLDN STPPIVTSLN LSSSHLTGII AQGIQNLTHL QELDLSNNNL TGGIPEFLAD IKSLLVINLS GNNFNGSIPQ ILLQKKGLKL ILEGNANLIC 501: PDGLCVNKAG NGGAKKMNVV IPIVASVAFV VVLGSALAFF FIFKKKKTSN SQDLGPSSYT QVSEVRTIRS SESAIMTKNR RFTYSEVVTM TNNFERVLGK 601: GGFGMVYHGT VNNTEQVAVK MLSHSSSQGY KEFKAEVELL LRVHHKNLVG LVGYCDEGEN LALIYEYMAN GDLREHMSGK RGGSILNWET RLKIVVESAQ 701: GLEYLHNGCK PPMVHRDVKT TNILLNEHLH AKLADFGLSR SFPIEGETHV STVVAGTPGY LDPEYYRTNW LNEKSDVYSF GIVLLEIITN QLVINQSREK 801: PHIAEWVGLM LTKGDIQNIM DPKLYGDYDS GSVWRAVELA MSCLNPSSAR RPTMSQVVIE LNECLSYENA RGGTSQNMNS ESSIEVSMNF DIGATPDAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)