AT3G10160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DHFS-FPGS homolog C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with tetrahydrofolylpolyglutamate synthase activity that is located in the mitochondrial matrix. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DHFS-FPGS homolog C (DFC); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mur ligase, central (InterPro:IPR013221), Folylpolyglutamate synthetase, conserved site (InterPro:IPR018109), Mur ligase, C-terminal (InterPro:IPR004101), Folylpolyglutamate synthetase (InterPro:IPR001645); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DHFS-FPGS homolog B (TAIR:AT5G05980.2); Has 7721 Blast hits to 7719 proteins in 2542 species: Archae - 43; Bacteria - 4847; Metazoa - 165; Fungi - 368; Plants - 133; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2165 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3139588..3143949 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68924.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 625 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLVCGKGFLK CRAPGVPFFC DKRKSFFTKT KRGFHSLPLG TGVRVYFNNN LRYSSNSIEV VEKAAINMGS KEDKADNPAL SSYDDAMEAL STLISRRNRG 101: DRTPTKGNRD KLEQVVTYLK ILDLEDKIKE LKVIHVAGTK GKGSTCVFSE AILRNCGFRT GMFTSPHLID VRERFRIDGL DISEEKFLQY FWECWKLLKE 201: KAVDGLTMPP LFQFLTVLAF KIFVCEKVDV AVIEVGLGGK LDSTNVIQKP VVCGIASLGM DHMDILGNTL ADIAFHKAGI FKPQIPAFTV PQLSEAMDVL 301: QKTANNLEVP LEVVAPLEPK KLDGVTLGLS GDHQLVNAGL AVSLSRCWLQ RTGNWKKIFP NESKETEIPV AFCRGLATAR LHGRAQVVHD VVSDPQDSSD 401: SMETPCGDLI FYLDGAHSPE SMEACGRWFS SAVRGDKSLS TAVNGYMRHG EYGTDLNRVS KQILLFNCME VRDPQVLLPK LVTTCASSGT HFSRALFVPS 501: MSTYNKVISG ASAIPSDTRR KDLTWQFRLQ RLWEKSIQGT DAGLDHTLKP DGITALPPHD FLCGDAPQCG GPAGTPVTSS AVMPSLPLTI NWLRDCVRRN 601: PSLKLEVLVT GSLHLVGDVL RLLKR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)