AT3G03600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein S2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Structural component of the mitochondrial ribosome small subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein S2 (RPS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S2 (InterPro:IPR001865), Ribosomal protein S2, conserved site (InterPro:IPR018130), Ribosomal protein S2, bacteria/mitochondria/plastid (InterPro:IPR005706); Has 7651 Blast hits to 7651 proteins in 2699 species: Archae - 6; Bacteria - 5327; Metazoa - 160; Fungi - 127; Plants - 183; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1848 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:867847..868506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24774.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 219 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIHAAVIQK LLNTGAHLGR RAAEHHFKQY AYGTRNGMTI IDSDKTLICL RSAAHFVANL AHMRGNIFFV NTNPLFDEII ELTSRRIQGD SYNHNRAMNL 101: WKMGGFLTNS YSPKKFRSRH KKLCFGPTTM PDCVVVFDSE RKSSVILEAS KLQIPVVAIV DPNVPLEFFE KITYPVPARD SVKFVYLFCN VITKCFVAEQ 201: MKLGIKEGSN EDLMKDLAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)