AT3G22300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein S10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Nuclear-encoded gene for mitochondrial ribosomal small subunit protein S10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein S10 (RPS10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S10 subgroup (InterPro:IPR005731), Ribosomal protein S10 (InterPro:IPR001848); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: putative mitochondrial RNA helicase 1 (TAIR:AT3G22310.1); Has 2936 Blast hits to 2936 proteins in 744 species: Archae - 0; Bacteria - 1485; Metazoa - 4; Fungi - 0; Plants - 119; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1328 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7885737..7886613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27089.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 241 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIAGVLRRSS LPSRQTLSAA LASFNSCISH NLTPATTGAS VSSRFTLASS PNSFGIRARN IHIRSEPSMI VPAGIASQGY ATVTKDRKNE IKKAKIKISP 101: DNVRPLSRKE IALQKEAAEE STSKIKGTKI CIAIRSFVNP EKQAWCLPPH TRKVAMPDTR TLYTVLRSPH VDKKSREQFE MRFKKRFLVI KAQSHELSKK 201: LFWLKRYRIL GAQYELQFHC KTRLDMTQVL GNINGSTTNA Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)