AT1G78000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 1;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sulfate transporter that can restore sulfate uptake capacity of a yeast mutant lacking sulfate transporter genes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 1;2 (SULTR1;2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 1;3 (TAIR:AT1G22150.1); Has 10127 Blast hits to 10032 proteins in 1879 species: Archae - 35; Bacteria - 6193; Metazoa - 1167; Fungi - 451; Plants - 560; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1721 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29329889..29332877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71711.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 653 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSRAHPVDG SPATDGGHVP MKPSPTRHKV GIPPKQNMFK DFMYTFKETF FHDDPLRDFK DQPKSKQFML GLQSVFPVFD WGRNYTFKKF RGDLISGLTI 101: ASLCIPQDIG YAKLANLDPK YGLYSSFVPP LVYACMGSSR DIAIGPVAVV SLLLGTLLRA EIDPNTSPDE YLRLAFTATF FAGITEAALG FFRLGFLIDF 201: LSHAAVVGFM GGAAITIALQ QLKGFLGIKK FTKKTDIISV LESVFKAAHH GWNWQTILIG ASFLTFLLTS KIIGKKSKKL FWVPAIAPLI SVIVSTFFVY 301: ITRADKQGVQ IVKHLDQGIN PSSFHLIYFT GDNLAKGIRI GVVAGMVALT EAVAIGRTFA AMKDYQIDGN KEMVALGMMN VVGSMSSCYV ATGSFSRSAV 401: NFMAGCQTAV SNIIMSIVVL LTLLFLTPLF KYTPNAILAA IIINAVIPLI DIQAAILIFK VDKLDFIACI GAFFGVIFVS VEIGLLIAVS ISFAKILLQV 501: TRPRTAVLGN IPRTSVYRNI QQYPEATMVP GVLTIRVDSA IYFSNSNYVR ERIQRWLHEE EEKVKAASLP RIQFLIIEMS PVTDIDTSGI HALEDLYKSL 601: QKRDIQLILA NPGPLVIGKL HLSHFADMLG QDNIYLTVAD AVEACCPKLS NEV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)