AT1G53430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Malectin/receptor-like protein kinase (InterPro:IPR021720), Leucine-rich repeat, typical subtype (InterPro:IPR003591), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase (TAIR:AT1G53440.1); Has 190391 Blast hits to 136728 proteins in 4882 species: Archae - 123; Bacteria - 17099; Metazoa - 53964; Fungi - 11192; Plants - 85200; Viruses - 463; Other Eukaryotes - 22350 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19935298..19940959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 113983.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1030 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MGFIFSTEKV VYVLLLIFVC LENFGSNAQL LPEDEVQTLR TIFRKLQNQT VNIERTSCSD QNWNFVVESA SNSPTSNITC DCTFNASSVC RVTNIQLKSF 0101: SLPGIFPPEF GNLTRLREID LSRNFLNGTI PTTLSQIPLE ILSVIGNRLS GPFPPQLGDI TTLTDVNLET NLFTGPLPRN LGNLRSLKEL LLSANNFTGQ 0201: IPESLSNLKN LTEFRIDGNS LSGKIPDFIG NWTLLERLDL QGTSMEGPIP PSISNLTNLT ELRITDLRGQ AAFSFPDLRN LMKMKRLGPI PEYIGSMSEL 0301: KTLDLSSNML TGVIPDTFRN LDAFNFMFLN NNSLTGPVPQ FIINSKENLD LSDNNFTQPP TLSCNQLDVN LISSYPSVTD NSVQWCLREG LPCPEDAKQS 0401: SLFINCGGSR LKIGKDTYTD DLNSRGQSTF SSVSERWGYS SSGVWLGKED AGYLATDRFN LINGSTPEYY KTARLSPQSL KYYGLCLRRG SYKLQLHFAE 0501: IMFSNDQTFN SLGRRIFDIY VQGNLLERDF NIAERAGGVG KPFIRQIDGV QVNGSTLEIH LQWTGKGTNV IPTRGVYGPL ISAITITPNF KVDTGKPLSN 0601: GAVAGIVIAA CAVFGLLVLV ILRLTGYLGG KEVDENEELR GLDLQTGSFT LKQIKRATNN FDPENKIGEG GFGPVYKGVL ADGMTIAVKQ LSSKSKQGNR 0701: EFVTEIGMIS ALQHPNLVKL YGCCIEGKEL LLVYEYLENN SLARALFGTE KQRLHLDWST RNKICIGIAK GLAYLHEESR LKIVHRDIKA TNVLLDLSLN 0801: AKISDFGLAK LNDDENTHIS TRIAGTIGYM APEYAMRGYL TDKADVYSFG VVCLEIVSGK SNTNYRPKEE FVYLLDWAYV LQEQGSLLEL VDPDLGTSFS 0901: KKEAMRMLNI ALLCTNPSPT LRPPMSSVVS MLEGKIKVQP PLVKREADPS GSAAMRFKAL ELLSQDSESQ VSTYARNREQ DISSSSMDGP WVDSSFSEPG 1001: KDVSLQQQEE GRSSSSSRKL LDDLTDVKIE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)