AT1G49960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Xanthine/uracil permease family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Xanthine/uracil permease family protein; FUNCTIONS IN: transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xanthine/uracil/vitamin C permease (InterPro:IPR006043); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Xanthine/uracil permease family protein (TAIR:AT5G62890.3); Has 9237 Blast hits to 9206 proteins in 1901 species: Archae - 67; Bacteria - 7526; Metazoa - 351; Fungi - 134; Plants - 458; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 695 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18498700..18501699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57821.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 526 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATKTDDFAP FPVKDQLPGV EFCVSSSPNW PEGIVLGFQH YIVMLGTTVI IPSILVPLMG GGDVEKAEVI NTVLFVSGIN TLLQSLFGSR LPVVMGASYA 101: YLIPALYITF SYRFTYYLHP HLRFEETMRA IQGALIIASI SHMIMGFFGL WRILVRFLSP LSAAPLVILT GVGLLAFAFP QLARCIEIGL PALIILIILS 201: QYLPHLFKCK RSICEQFAVL FTIAIVWAYA EILTAAGAYD KRPDNTQLSC RTDRSGLISA SPWVRIPYPL QWGRPSFHGS DAFAMMAATY VAIVETTGSF 301: IAASRFGSAT HIPPSVLSRG IGWQGIGVLL NGLFGTATGS TALVENTGLL GLTKVGSRRV VQISAGFMIF FSIFGKFGAV LASIPLPIFA ALYCVLFAYV 401: ASAGLGLLQF CNLNSFRNKF ILGFSIFIGL SVAQYFTEYL FISGRGPVHT RTSAFNVIMQ VIFSSAATVG IMAAFLLDCT HSYGHASVRR DSGRHWWEKF 501: RVYHTDTRTE EFYALPYNLN RFFPSF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)