AT1G22170.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoglycerate mutase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoglycerate mutase family protein; FUNCTIONS IN: intramolecular transferase activity, phosphotransferases, catalytic activity; INVOLVED IN: glycolysis, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine phosphatase superfamily, clade-1 (InterPro:IPR013078), Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase, active site (InterPro:IPR001345), Phosphoglycerate mutase 1 (InterPro:IPR005952); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase (TAIR:AT1G78050.1); Has 12525 Blast hits to 12398 proteins in 2288 species: Archae - 62; Bacteria - 8805; Metazoa - 605; Fungi - 308; Plants - 169; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2576 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7826603..7828055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37296.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATATSHQSV VSFASLRSSP SSTISQCGFK IDSSLSFTSK KTNFCKIKAM ASSVSYDNTL LSPSKTIPDN SQKKSNEAAL ILIRHGESLW NEKNLFTGCV 101: DVPLTEKGVE EAIEAGKRIS NIPVDVIFTS SLIRAQMTAM LAMIQHRRKK VPIILHDESE QAKTWSQVFS DETKNQSIPV IPAWQLNERM YGELQGLNKQ 201: ETAERYGKEQ VHEWRRSYDI PPPKGESLEM CAERAVAYFQ DNIEPKLAAG KNVMIAAHGN SLRSIIMYLD KLTCQEVISL ELSTGIPLLY IFKEGKFMKR 301: GSPVGPTEAG VYAYTKRLAQ YRQKLEDDSE VLCA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)