AT1G16540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.855 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : molybdenum cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes molybdenum cofactor sulfurase. Involved in Moco biosynthesis. Involved in the conversion of ABA-aldehyde to ABA, the last step of abscisic acid (ABA) biosynthesis. <i>sir</i> loss-of-function mutants are resistant to sirtinol, a modulator of auxin signaling.N terminal domain is similar to bacterial NifS suggesting a common mechanism for sulphur mobilization and transfer. Also involved in protein import into chloroplasts. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABA DEFICIENT 3 (ABA3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), MOSC, N-terminal beta barrel (InterPro:IPR005303), Aminotransferase, class V/Cysteine desulfurase (InterPro:IPR000192), Molybdenum cofactor sulfurase, C-terminal (InterPro:IPR005302), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Molybdenum cofactor sulfurase family protein (TAIR:AT1G30910.1); Has 7940 Blast hits to 7904 proteins in 1914 species: Archae - 94; Bacteria - 5396; Metazoa - 390; Fungi - 394; Plants - 292; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 1373 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5659465..5665201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91807.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 819 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAFLKEFGD YYGYPDGPKN IQEIRDTEFK RLDKGVVYLD HAGSTLYSEL QMEYIFKDFT SNVFGNPHSQ SDISSATSDL IADARHQVLE YFNASPEDYS 101: CLFTSGATAA LKLVGETFPW TQDSNFLYTM ENHNSVLGIR EYALAQGASA CAVDIEEAAN QPGQLTNSGP SIKVKHRAVQ MRNTSKLQKE ESRGNAYNLF 201: AFPSECNFSG LRFNLDLVKL MKENTETVLQ GSPFSKSKRW MVLIDAAKGC ATLPPDLSEY PADFVVLSFY KLFGYPTGLG ALLVRNDAAK LLKKTYFSGG 301: TVAASIADID FVKRRERVEE FFEDGSASFL SIAAIRHGFK LLKSLTPSAI WMHTTSLSIY VKKKLQALRH GNGAAVCVLY GSENLELSSH KSGPTVTFNL 401: KRPDGSWFGY LEVEKLASLS GIQLRTGCFC NPGACAKYLE LSHSELRSNV EAGHICWDDN DVINGKPTGA VRVSFGYMST FEDAKKFIDF IISSFASPPK 501: KTGNGTVVSG RFPQLPSEDL ESKESFPSHY LKSITVYPIK SCAGFSVIRW PLCRTGLLHD REWMVQGLTG EILTQKKVPE MSLIKTFIDL EEGLLSVESS 601: RCEDKLHIRI KSDSYNPRND EFDSHANILE NRNEETRINR WFTNAIGRQC KLLRYSSSTS KDCLNRNKSP GLCRDLESNI NFANEAQFLL ISEESVADLN 701: RRLEAKDEDY KRAHEKLNPH RFRPNLVISG GEPYGEDKWK TVKIGDNHFT SLGGCNRCQM INISNEAGLV KKSNEPLTTL ASYRRVKGKI LFGTLLRYEI 801: DEKRQCWIGV GEEVNPDIE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)