AT1G16010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.894 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium transporter 2 (MGT2); FUNCTIONS IN: magnesium ion transmembrane transporter activity, metal ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: metal ion transport, transmembrane transport; LOCATED IN: vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 32 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mg2+ transporter protein, CorA-like (InterPro:IPR002523); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 1 (TAIR:AT1G80900.1); Has 790 Blast hits to 772 proteins in 170 species: Archae - 2; Bacteria - 29; Metazoa - 62; Fungi - 196; Plants - 407; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 94 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5495462..5497082 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50422.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSELKERLLP PRPASAMNLR DASVTRPSAS GRPPLLGVDV LGLKKRGQGL RSWIRVDTSG NTQVMEVDKF TMMRRCDLPA RDLRLLDPLF VYPSTILGRE 101: KAIVVNLEQI RCIITADEVL LLNSLDNYVL RYVVELQQRL KTSSVGEMWQ QENSQLSRRR SRSFDNAFEN SSPDYLPFEF RALEIALEAA CTFLDSQASE 201: LEIEAYPLLD ELTSKISTLN LERVRRLKSR LVALTRRVQK VRDEIEQLMD DDGDMAEMYL TEKKRRMEGS MYGDQSLLGY RSNDGLSVSA PVSPVSSPPD 301: SRRLDKSLSI ARSRHDSARS SEGAENIEEL EMLLEAYFVV IDSTLNKLTS LKEYIDDTED FINIQLDNVR NQLIQFELLL TTATFVVAIF GVVAGIFGMN 401: FEIDFFNQPG AFRWVLIITG VCGFVIFSAF VWFFKYRRLM PL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)