AT1G09960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose transporter 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
low affinity (10mM) sucrose transporter in sieve elements (phloem) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose transporter 4 (SUT4); FUNCTIONS IN: sucrose transmembrane transporter activity, carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity, sucrose:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: sucrose transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose/H+ symporter, plant (InterPro:IPR005989), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose-proton symporter 2 (TAIR:AT1G22710.1); Has 2568 Blast hits to 2441 proteins in 632 species: Archae - 30; Bacteria - 1104; Metazoa - 451; Fungi - 193; Plants - 403; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 387 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3244258..3246718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54787.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 510 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSDQDRRH RVTRNRPPIA RPSTSSSRPV VSPPRSKVSK RVLLRVASVA CGIQFGWALQ LSLLTPYVQE LGIPHAWASV IWLCGPLSGL FVQPLVGHSS 101: DRCTSKYGRR RPFIVAGAVA ISISVMVIGH AADIGWAFGD REGKIKPRAI VAFVLGFWIL DVANNMTQGP CRALLADLTE NDNRRTRVAN GYFSLFMAVG 201: NVLGYATGSY NGWYKIFTFT KTVACNVECA NLKSAFYIDV VFIAITTILS VSAAHEVPLA SLASEAHGQT SGTDEAFLSE IFGTFRYFPG NVWIILLVTA 301: LTWIGWFPFI LFDTDWMGRE IYGGEPNIGT SYSAGVSMGA LGLMLNSVFL GITSVLMEKL CRKWGAGFVW GISNILMAIC FLGMIITSFV ASHLGYIGHE 401: QPPASIVFAA VLIFTILGIP LAITYSVPYA LISIRIESLG LGQGLSLGVL NLAIVIPQVI VSVGSGPWDQ LFGGGNSPAL AVGAATGFIG GIVAILALPR 501: TRIQKPIPLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)