AT5G63680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyruvate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyruvate kinase family protein; FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity, potassium ion binding, magnesium ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, glycolysis; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, active site (InterPro:IPR018209), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyruvate kinase family protein (TAIR:AT5G08570.1); Has 10212 Blast hits to 10099 proteins in 2690 species: Archae - 168; Bacteria - 6017; Metazoa - 548; Fungi - 219; Plants - 540; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2720 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25490507..25492530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55021.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 510 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNIDIEGIL KELPNDGRTP KTKIVCTLGP ASRSVTMIEK LLKAGMNVAR FNFSHGSHEY HQETLDNLRT AMQNTGILAA VMLDTKGPEI RTGFLKDGNP 101: IQLKEGQEIT ITTDYDIKGD EKTISMSYKK LPVDVKPGNT ILCADGSISL AVVSCDPNAG TVICRCENTA MLGERKNVNL PGVVVDLPTL TDKDVEDILK 201: WGVPNNIDMI ALSFVRKGSD LVNVRKVLGS HSKSIMLMSK VENQEGVLNF DEILRETDAF MVARGDLGME IPIEKIFLAQ KMMIYKCNLA GKPVVTATQM 301: LESMIKSPRP TRAEATDVAN AVLDGTDCVM LSGESAAGAY PEIAVKTMAK ICIEAESSLD YNTIFKEMIR ATPLPMSTLE SLASSAVRTA NKAKAKLIIV 401: LTRGGTTAKL VAKYRPAVPI LSVVVPVFTS DTFNWSCSDE SPARHSLIYR GLIPVLGEGS AKATDSESTE EIIESALKSA TEKGLCNHGD AVVALHRIGA 501: ASVIKICVVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)