AT4G26910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydrolipoamide succinyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Dihydrolipoamide succinyltransferase; FUNCTIONS IN: zinc ion binding, acyltransferase activity; INVOLVED IN: tricarboxylic acid cycle, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydrolipoamide succinyltransferase (InterPro:IPR006255), 2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site (InterPro:IPR003016), 2-oxoacid dehydrogenase acyltransferase, catalytic domain (InterPro:IPR001078), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Biotin/lipoyl attachment (InterPro:IPR000089); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydrolipoamide succinyltransferase (TAIR:AT5G55070.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13520127..13522889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50062.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 464 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMMRAVIRRA ASNGSSPSLF AKSLQSSRVA ASSPSLLSGS ETGAYLHRGN HAHSFHNLAL PAGNSGISRS ASLVSSTLQR WVRPFSAETG DTVEAVVPHM 101: GESITDGTLA TFLKKPGERV QADEAIAQIE TDKVTIDIAS PASGVIQEFL VNEGDTVEPG TKVAIISKSE DTASQVTPSQ KIPETTDTKP SPPAEDKQKP 201: RVESAPVAEK PKAPSSPPPP KQSAKEPQLP PKERERRVPM TRLRKRVATR LKDSQNTFAL LTTFNEVDMT NLMKLRSQYK DAFYEKHGVK LGLMSGFIKA 301: AVSALQHQPV VNAVIDGDDI IYRDYVDISI AVGTSKGLVV PVIRGADKMN FAEIEKTINS LAKKANEGTI SIDEMAGGSF TVSNGGVYGS LISTPIINPP 401: QSAILGMHSI VSRPMVVGGS VVPRPMMYVA LTYDHRLIDG REAVYFLRRV KDVVEDPQRL LLDI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)