AT4G13310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.948 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 20 (CYP71A20); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 19 (TAIR:AT4G13290.1); Has 33816 Blast hits to 33612 proteins in 1682 species: Archae - 67; Bacteria - 3972; Metazoa - 11836; Fungi - 7179; Plants - 9534; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1225 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7750453..7753049 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56501.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 497 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMILITLCL TTLLALLLKS ILKRTATKNF NLPPSPWRLP VIGNLHQLSL HTHRSLRSLS LRYGPLMLLH FGRTPVLIVS SADVAHDVMK THDLVCANRP 101: KTKVVDKILS GGRDVAFAPY GEYWRQMKSI CIQNLLNNKM VRSYEKIREE EIKRMIEKLE KASCSSSPSP VNLSQILMTL TNDIICRVAL GRKYSGKKDG 201: IDVENIVRTF AALLGEFPVG EYIPSLSWID RIRGLDHKME VVDKRFDEFL ERVVKEHEEA DKETRSDLVD KLLTIQSDKT GQFELEKSAL KLIIWDMFLA 301: GTATTLSFLE WAMTELMRNP KVMKKLQEEI RSSSPQDLFV TEKEAEKMNY LQAVIKEALR LRPPAPLLVP RVLSEDVKLK GYNIPAGTQV IVNAWAIQRD 401: TTTWGTDAEE FKPERHLDTN LDFQGQDFKF IPFGSGKRIC PGIGFTSALI GVTLANIVKR FNWRMDVEPQ RVQHDLTEAT GLVVFRKFPL IAIPSSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)