AT4G04700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 27 (CPK27); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, calcium ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cytosol; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 31 (TAIR:AT4G04695.1); Has 138423 Blast hits to 130316 proteins in 4788 species: Archae - 147; Bacteria - 14221; Metazoa - 51107; Fungi - 18194; Plants - 30674; Viruses - 497; Other Eukaryotes - 23583 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:2385276..2387986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54901.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 485 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGCFSSKELQ QSKRTILEKP LVDITKIYIL GEELGRGNFG LTRKCVEKST GKTFACKTIL KTKLKDEECE EDVKREIRIM KQLSGEPNIV EFKNAYEDKD 101: SVHIVMEYCG GGELYDKILA LYDVGKSYSE KEAAGIIRSI VNVVKNCHYM GVMHRDLKPE NFLLTSNDDN ATVKVIDFGC SVFIEEGKVY QDLAGSDYYI 201: APEVLQGNYG KEADIWSAGI ILYILLCGKS PFVKEPEGQM FNEIKSLEID YSEEPWPLRD SRAIHLVKRM LDRNPKERIS AAEVLGHPWM KEGEASDKPI 301: DGVVLSRLKR FRDANKFKKV VLKFIAANLS EEEIKGLKTL FTNIDTDKSG NITLEELKTG LTRLGSNLSK TEVEQLMEAA DMDGNGTIDI DEFISATMHR 401: YKLDRDEHVY KAFQHFDKDN DGHITKEELE MAMKEDGAGD EGSIKQIIAD ADTDNDGKIN FEEFRTMMRT ESSLQPEGEL LPIIN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)