AT3G59410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GCN2; FUNCTIONS IN: protein tyrosine kinase activity, protein kinase activity, aminoacyl-tRNA ligase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, translation; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Anticodon-binding (InterPro:IPR004154), Tyrosine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008266), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), RWD (InterPro:IPR006575); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Class II aaRS and biotin synthetases superfamily protein (TAIR:AT3G02760.1); Has 102900 Blast hits to 101457 proteins in 4494 species: Archae - 105; Bacteria - 12314; Metazoa - 36099; Fungi - 10698; Plants - 26119; Viruses - 326; Other Eukaryotes - 17239 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21950575..21959151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 140329.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1241 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MGRSSSKKKK KRGGSGRRGQ LKDHGSNADE DNELLSEEIT ALSAIFQEDC KVVSDSRSPP QIAIKLRPYS KDMGYEDTDI SAMLIVRCLP GYPYKCPKLQ 0101: ITPEQGLTTA DAEKLLSLLE DQANSNAREG RVMIFNLVEA AQEFLSEIIP ESHDEESVPC LTAHRSTQFI EQPMLSNIAK SCSGGPFVYG FIDLFSGLED 0201: ARNWSLTPDE NRGIVSSVQS HPLDTSRILH QKPDKNLKRF EDHAKEEVAL PAPIAKLNTV QEENVDDTSI SSFDSSKSTD DVESGLFQNE KKESNLQDDT 0301: AEDDSTNSES ESLGSWSSDS LAQDQVPQIS KKDLLMVHLL RVACTSRGPL ADALPQITDE LHELGILSEE VLDLASKSSP DFNRTFEHAF NQNMASTSVP 0401: QFWEPPSDSC EPNASLPSSR YLNDFEELKP LGQGGFGHVV LCKNKLDGRQ YAVKKIRLKD KEIPVNSRIV REVATLSRLQ HQHVVRYYQA WFETGVVDPF 0501: AGANWGSKTA GSSMFSYSGA VSTEIPEQDN NLESTYLYIQ MEYCPRTLRQ VFESYNHFDK DFAWHLIRQI VEGLAHIHGQ GIIHRDFTPN NIFFDARNDI 0601: KIGDFGLAKF LKLEQLDQDG GFSTDVAGSG VDSTGQAGTY FYTAPEIEQD WPKIDEKADM YSLGVVFFEL WHPFGTAMER HVILTNLKLK GELPLKWVNE 0701: FPEQASLLRR LMSPSPSDRP SATELLKHAF PPRMESELLD NILRIMQTSE DSSVYDRVVS VIFDEEVLEM KSHQSSRSRL CADDSYIQYT EINTELRDYV 0801: VEITKEVFRQ HCAKHLEVIP MRLLSDCPQF SRKTVKLLTN GGDMLELCYE LRLPFVHWIS VNQKSSFKRY EISHVYRRAI GHSPPNPCLQ ADFDIVGGTL 0901: SLTEAEVLKV IVDITTHIFH RGSCDIHLNH GDLLDAIWSW AGIKAEHRRK VAELLSMMGS LRPQSSERKL KWVFIRRQLL QELKLPEAVV NRLQTVASRF 1001: CGDADQALPR LRGALRADRP TRKALDELSN LLTYLRVWRI EEHVHIDVLM PPTESYHRNL FFQVFLTKEN SSGTSNDGVL LAVGGRYDWL VQEVCDREHK 1101: MNLPGAVGVS LALETIFQHL PMDLRPIRNE VSTSVLVCSR GGGGLLVQRM ELVAELWEKS IKAEFVPTPD PSLTEQYEYA NEHEIKCLVI ITESGVAQNQ 1201: IEFVKVRHLE LKKEKVVGRE ELVKFLLDAM AVQFRNPSVW S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)