AT3G53280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome p450 71b5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytochrome P450 monooxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome p450 71b5 (CYP71B5); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 38 (TAIR:AT3G44250.1); Has 33134 Blast hits to 32894 proteins in 1695 species: Archae - 47; Bacteria - 3311; Metazoa - 12038; Fungi - 6892; Plants - 9686; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1157 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19755749..19757466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56377.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 498 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSIFLCFLLL LPLSLIFLKK LLPSKGKLPP GPKGLPIIGN LHQFGRFLHK SLHKISQEYG PVMLLHFGVV PVIIVSSKEG AEEVLKTHDL ETCSRPKTVG 101: SGLFTYNFKD IGFAPYGENW REMRKIAVSE LFSQKKLKSF RYIREDESQL LVRKVSKSAL ETPTSSVNLR KVIFTFAASI ICRLSFGQNF CDFVDMETVE 201: ELVLESETNL GSLAFADFLP AGWIIDRISG QHSTVMKAFS KLTNFFELVI DDHLKSGKIE DHSDIISVML DMINKPTEVG SYKVTDDHLK GLMSDVFLAG 301: VNAGSITMIW TMTELSRHPR VMRKLQEEIR AALGPNKEKI TEEDLEKVEY LKMVIEEAFR LHPPAPLLLP RLTMSDINIQ GYSIPKNTMI QINTYTIGRD 401: PKNWTKPDEF IPERFVDNPI EYKGQHFELL PFGAGRRVCP GMATGITIVE LGLLSLLYFF DWSLPNGMTT KDIDMEEDGA FVIAKKVSLE LVPTLHRW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)