AT2G19170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : subtilisin-like serine protease 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a novel subtilisin-like serine protease. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
subtilisin-like serine protease 3 (SLP3); FUNCTIONS IN: serine-type peptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, negative regulation of catalytic activity; LOCATED IN: middle lamella-containing extracellular matrix; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Proteinase inhibitor, propeptide (InterPro:IPR009020), Peptidase S8A, DUF1034 C-terminal (InterPro:IPR010435), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PA-domain containing subtilase family protein (TAIR:AT4G30020.1); Has 7824 Blast hits to 6803 proteins in 1147 species: Archae - 185; Bacteria - 4676; Metazoa - 73; Fungi - 358; Plants - 1850; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 682 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8314154..8317620 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87671.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 815 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDIGLRIFVV FVLLVAVTAE VYIVTMEGDP IISYKGGENG FEATAVESDE KIDTSSELVT VYARHLERKH DMILGMLFEE GSYKKLYSYK HLINGFAAHV 101: SPEQAETLRR APGVRSVDKD WKVRRLTTHT PEFLGLPTDV WPTGGGFDRA GEDIVIGFVD SGIYPHHPSF ASHHRLPYGP LPHYKGKCEE DPHTKKSFCN 201: RKIVGAQHFA EAAKAAGAFN PDIDYASPMD GDGHGSHTAA IAAGNNGIPL RMHGYEFGKA SGMAPRARIA VYKALYRLFG GFVADVVAAI DQAVHDGVDI 301: LSLSVGPNSP PTTTKTTFLN PFDATLLGAV KAGVFVAQAA GNGGPFPKTL VSYSPWITTV AAAIDDRRYK NHLTLGNGKM LAGMGLSPPT RPHRLYTLVS 401: ANDVLLDSSV SKYNPSDCQR PEVFNKKLVE GNILLCGYSF NFVVGTASIK KVVATAKHLG AAGFVLVVEN VSPGTKFDPV PSAIPGILIT DVSKSMDLID 501: YYNASTSRDW TGRVKSFKAE GSIGDGLAPV LHKSAPQVAL FSARGPNTKD FSFQDADLLK PDILAPGYLI WAAWCPNGTD EPNYVGEGFA LISGTSMAAP 601: HIAGIAALVK QKHPQWSPAA IKSALMTTST VIDRAGRLLQ AQQYSDTEAV TLVKATPFDY GSGHVNPSAA LDPGLIFDAG YEDYLGFLCT TPGISAHEIR 701: NYTNTACNYD MKHPSNFNAP SIAVSHLVGT QTVTRKVTNV AEVEETYTIT ARMQPSIAIE VNPPAMTLRP GATRTFSVTM TVRSVSGVYS FGEVKLKGSR 801: GHKVRIPVVA LGHRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)