AT2G14255.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.918 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ankyrin repeat family protein with DHHC zinc finger domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ankyrin repeat family protein with DHHC zinc finger domain; FUNCTIONS IN: zinc ion binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, DHHC-type (InterPro:IPR001594), Ankyrin repeat-containing domain (InterPro:IPR020683), Ankyrin repeat (InterPro:IPR002110); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ankyrin repeat family protein with DHHC zinc finger domain (TAIR:AT5G20350.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:6036974..6040892 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59990.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 536 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSSEIEVVP LDSNSHQSPT ESPTITDVFS ASAYGDLHQL KHFVEHNGSS VSLPDDNGFY ALQWAALNNS LHVAQYIIQH GGDVNSADNI QQTPLHWAAV 101: KGSIDVADLL LQHGARIEAV DVNGFRAVHV ASQYGQTAFV NHIIVDYAAD YNALDIEGRS PLHWAAYNGF TETVRLLLFR DACQNRQDNT GCTPLHWAVI 201: KENVEACTLL VHAGTKEELI LKDNTGSTPL KLASDKGHRQ LALFLSKAMR TRKNSFVDKI FCGKLGETSY APMLFSLIVI LMVLFITSIV SASNLPKITA 301: MVGLWACFGL SCGVYALITF YRVSRKDPGY VKRTGEANSQ HTANDPLIDI NFKNPSWKGN WSQLCPTCKI IRPVRSKHCP TCKRCVEQFD HHCPWISNCV 401: GKKNKRYFLV FVIMGALTSF VGGTTAVQRL WRGIPQVHHG ESWIKHIVIE HPDAAVFLFF DLLIFIATMT LTISQSYMIA RNITTNELWN AKRFSYLRGP 501: DGRFYNPYNH GLRRNCTDFL VHGYTRDDEV VPSSIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)