AT2G07687.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome c oxidase, subunit III | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome c oxidase, subunit III; FUNCTIONS IN: cytochrome-c oxidase activity; INVOLVED IN: mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase, subunit III (InterPro:IPR000298); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome c oxidase subunit 3 (TAIR:ATMG00730.1); Has 29038 Blast hits to 29025 proteins in 5946 species: Archae - 74; Bacteria - 4466; Metazoa - 19232; Fungi - 401; Plants - 673; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4192 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:3311854..3312651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29744.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIESQRHSYH LVDPSPWPIS GSLGALATTV GGVMYMHPFQ GGARLLSLGL IFILYTMFVW WRDVLRESTL EGHHTKVVQL GPRYGSILFI VSEVMFFFAF 101: FWASSHSSLA PAVEIGGIWP PKGIEVLDPW EIPFLNTPIL PSSGAAVTWA HHAILAGKEK RAVYALVATV LLALVFTGFQ GMEYYQAPFT ISDSIYGSTF 201: FLATGFHGFH VIIGTLFLII CGIRQYLGHL TKEHHVGFEA AAWYWHFVDV VWLFLFVSIY WWGGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)