AT2G03480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.982 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : QUASIMODO2 LIKE 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes QUASIMODO2 LIKE2 (QUL2), a paralog of QUASIMODO2 (QUA2). AT1G78240 (QUA2), AT1G13860 (QUL1) and AT2G03480 (QUL2) form a clade with a possible role in plant vasculature development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
QUASIMODO2 LIKE 2 (QUL2); LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: male gametophyte, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: QUASIMODO2 LIKE 1 (TAIR:AT1G13860.3); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:1051509..1054090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67822.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 606 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRGSWYKSVS SVFGLRPRIR GLLFFIVGVV ALVTILAPLT SNSYDSSSSS TLVPNIYSNY RRIKEQAAVD YLDLRSLSLG ASLKEFPFCG KERESYVPCY 101: NITGNLLAGL QEGEELDRHC EFEREKERCV VRPPRDYKIP LRWPLGRDII WSGNVKITKD QFLSSGTVTT RLMLLEENQI TFHSEDGLVF DGVKDYARQI 201: AEMIGLGSDT EFAQAGVRTV LDIGCGFGSF GAHLVSLKLM PICIAEYEAT GSQVQLALER GLPAMIGNFF SKQLPYPALS FDMVHCAQCG TTWDIKDAML 301: LLEVDRVLKP GGYFVLTSPT NKAQGNLPDT KKTSISTRVN ELSKKICWSL TAQQDETFLW QKTSDSSCYS SRSQASIPLC KDGDSVPYYH PLVPCISGTT 401: SKRWISIQNR SAVAGTTSAG LEIHGKSALK NYWSLLTPLI FSDHPKRPGD EDPLPPFNMI RNVMDMHARF GNLNAALLDE GKSAWVMNVV PVNARNTLPI 501: ILDRGFAGVL HDWCEPFPTY PRTYDMLHAN ELLTHLSSER CSLMDLFLEM DRILRPEGWV VLSDKVGVIE MARALAARVR WEARVIDLQD GSDQRLLVCQ 601: KPFIKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)