AT1G24650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT2G01820.1); Has 163262 Blast hits to 131858 proteins in 4814 species: Archae - 197; Bacteria - 15893; Metazoa - 48579; Fungi - 11073; Plants - 66376; Viruses - 415; Other Eukaryotes - 20729 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8734570..8737315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97411.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 886 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIAKNFLLLL CFIALVNVES SPDEAVMIAL RDSLKLSGNP NWSGSDPCKW SMFIKCDASN RVTAIQIGDR GISGKLPPDL GKLTSLTKFE VMRNRLTGPI 101: PSLAGLKSLV TVYANDNDFT SVPEDFFSGL SSLQHVSLDN NPFDSWVIPP SLENATSLVD FSAVNCNLSG KIPDYLFEGK DFSSLTTLKL SYNSLVCEFP 201: MNFSDSRVQV LMLNGQKGRE KLHGSISFLQ KMTSLTNVTL QGNSFSGPLP DFSGLVSLKS FNVRENQLSG LVPSSLFELQ SLSDVALGNN LLQGPTPNFT 301: APDIKPDLNG LNSFCLDTPG TSCDPRVNTL LSIVEAFGYP VNFAEKWKGN DPCSGWVGIT CTGTDITVIN FKNLGLNGTI SPRFADFASL RVINLSQNNL 401: NGTIPQELAK LSNLKTLDVS KNRLCGEVPR FNTTIVNTTG NFEDCPNGNA GKKASSNAGK IVGSVIGILL ALLLIGVAIF FLVKKKMQYH KMHPQQQSSD 501: QDAFKITIEN LCTGVSESGF SGNDAHLGEA GNIVISIQVL RDATYNFDEK NILGRGGFGI VYKGELHDGT KIAVKRMESS IISGKGLDEF KSEIAVLTRV 601: RHRNLVVLHG YCLEGNERLL VYQYMPQGTL SRHIFYWKEE GLRPLEWTRR LIIALDVARG VEYLHTLAHQ SFIHRDLKPS NILLGDDMHA KVADFGLVRL 701: APEGTQSIET KIAGTFGYLA PEYAVTGRVT TKVDVYSFGV ILMELLTGRK ALDVARSEEE VHLATWFRRM FINKGSFPKA IDEAMEVNEE TLRSINIVAE 801: LANQCSSREP RDRPDMNHVV NVLVSLVVQW KPTERSSDSE DIYGIDYDTP LPQLILDSCF FGDNTLTSIP SRPSELESTF KSGQGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)