AT4G29840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
threonine synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2 (MTO2); FUNCTIONS IN: threonine synthase activity; INVOLVED IN: threonine biosynthetic process, metabolic process, cellular amino acid metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Threonine synthase (InterPro:IPR004450), Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit (InterPro:IPR001926), Serine/threonine dehydratase, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR000634); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme family protein (TAIR:AT1G72810.1); Has 6824 Blast hits to 6824 proteins in 2025 species: Archae - 409; Bacteria - 4266; Metazoa - 101; Fungi - 24; Plants - 83; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1941 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14599434..14601014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57780.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 526 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSCLFNAS VSSLNPKQDP IRRHRSTSLL RHRPVVISCT ADGNNIKAPI ETAVKPPHRT EDNIRDEARR NRSNAVNPFS AKYVPFNAAP GSTESYSLDE 101: IVYRSRSGGL LDVEHDMEAL KRFDGAYWRD LFDSRVGKST WPYGSGVWSK KEWVLPEIDD DDIVSAFEGN SNLFWAERFG KQFLGMNDLW VKHCGISHTG 201: SFKDLGMTVL VSQVNRLRKM KRPVVGVGCA STGDTSAALS AYCASAGIPS IVFLPANKIS MAQLVQPIAN GAFVLSIDTD FDGCMKLIRE ITAELPIYLA 301: NSLNSLRLEG QKTAAIEILQ QFDWQVPDWV IVPGGNLGNI YAFYKGFKMC QELGLVDRIP RMVCAQAANA NPLYLHYKSG WKDFKPMTAS TTFASAIQIG 401: DPVSIDRAVY ALKKCNGIVE EATEEELMDA MAQADSTGMF ICPHTGVALT ALFKLRNQGV IAPTDRTVVV STAHGLKFTQ SKIDYHSNAI PDMACRFSNP 501: PVDVKADFGA VMDVLKSYLG SNTLTS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)