AT4G09010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ascorbate peroxidase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein that was initially believed to act as a microsomal ascorbate peroxidase APX4 but to date, no evidence of enzymatic activity has been found. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ascorbate peroxidase 4 (APX4); FUNCTIONS IN: peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ascorbate peroxidase 5 (TAIR:AT4G35970.1); Has 1182 Blast hits to 1180 proteins in 264 species: Archae - 20; Bacteria - 119; Metazoa - 0; Fungi - 348; Plants - 604; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 91 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:5777502..5779338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37936.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGVSFLSTV PSFTNTTNHQ HLTTLSSSSH RSAVIRCSKI EPQVSGESLA FHRRDVLKLA GTAVGMELIG NGFINNVGDA KAADLNQRRQ RSEFQSKIKI 101: LLSTTIKAKP ELVPSLLKLA LNDAMTYDKA TKSGGANGSI RFSSELSRAE NEGLSDGLSL IEEVKKEIDS ISKGGPISYA DIIQLAGQSA VKFTYLASAI 201: RKCGGNEEKG NLLYTAYGSA GQWGLFDRNF GRSDATEADP EGRVPQWGKA TVQEMKDKFI AVGLGPRQLA VMSAFLGPDQ AATEQLLATD PQVAPWVQKY 301: QRSRETVSQT DYEVDLITAF TKLSCLGQQI NFEAYTYPVE RINLSKLKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)