AT3G52750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Tubulin/FtsZ family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Nuclear gene that encodes a plastidial division protein (FtsZ2-2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FTSZ2-2; FUNCTIONS IN: structural molecule activity, GTP binding, GTPase activity; INVOLVED IN: protein polymerization; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cell division protein FtsZ, N-terminal (InterPro:IPR000158), Cell division protein FtsZ, conserved site (InterPro:IPR020805), Tubulin/FtsZ, GTPase domain (InterPro:IPR003008), Tubulin/FtsZ, N-terminal (InterPro:IPR019746), Tubulin/FtsZ, C-terminal (InterPro:IPR008280), Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain (InterPro:IPR018316); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tubulin/FtsZ family protein (TAIR:AT2G36250.2); Has 10464 Blast hits to 10464 proteins in 3156 species: Archae - 455; Bacteria - 6195; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 153; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3653 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19549841..19552435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50320.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 473 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAYVSPCLT PPDSRVLTVL RKSVLPDHHL GTRVGCLRMS EGTTKRYRVV ASHKYESSSI RNSLNSHSTS HFQSQDSFLN LHPEISMLNP RKETSSVPIT 101: EDLDELSTPN TYNEARIKVI GVGGGGSNAV NRMIESEMIG VEFWIVNTDI QAMRISPVFP DNRLQIGKEL TRGLGAGGNP EIGMNAATES KEAIQEALYG 201: SDMVFVTAGM GGGTGTGGAP IIAGVAKAMG ILTVGIVTTP FSFEGRRRAL QAQEGIAALR DNVDTLIVIP NDKLLAAVSQ STPVTEAFNL ADDILRQGVR 301: GISDIITIPG LVNVDFADVR AIMANAGSSL MGIGTATGKT RARDAALNAI QSPLLDIGIE RATGIVWNIT GGSDLTLFEV NAAAEVIYDL VDPTANLIFG 401: AVVDPSYSGQ ISITLIATGF KRQEEGEGRP LQATQADASM GATRRPSSSF TEGSSIEIPE FLKKKGRSRY PRL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)