AT1G61500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.603 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: shoot apex, embryo, flower, seed; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Apple-like (InterPro:IPR003609), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61490.1); Has 123382 Blast hits to 121623 proteins in 4622 species: Archae - 108; Bacteria - 13648; Metazoa - 45596; Fungi - 10441; Plants - 35145; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 18019 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22689729..22692881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 90335.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 804 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMTRFACLHL FTMFLFTLLS GSSSAVITTE SPLSMGQTLS SANEVYELGF FSPNNTQDQY VGIWFKDTIP RVVVWVANRE KPVTDSTAYL AISSSGSLLL 101: LNGKHGTVWS SGVTFSSSGC RAELSDSGNL KVIDNVSERA LWQSFDHLGD TLLHTSSLTY NLATAEKRVL TSWKSYTDPS PGDFLGQITP QVPSQGFVMR 201: GSTPYWRSGP WAKTRFTGIP FMDESYTGPF TLHQDVNGSG YLTYFQRDYK LSRITLTSEG SIKMFRDNGM GWELYYEAPK KLCDFYGACG PFGLCVMSPS 301: PMCKCFRGFV PKSVEEWKRG NWTGGCVRHT ELDCLGNSTG EDADDFHQIA NIKPPDFYEF ASSVNAEECH QRCVHNCSCL AFAYIKGIGC LVWNQDLMDA 401: VQFSATGELL SIRLARSELD GNKRKKTIVA SIVSLTLFMI LGFTAFGVWR CRVEHIAHIS KDAWKNDLKP QDVPGLDFFD MHTIQNATNN FSLSNKLGQG 501: GFGSVYKGKL QDGKEIAVKR LSSSSGQGKE EFMNEIVLIS KLQHRNLVRV LGCCIEEEEK LLIYEFMVNK SLDTFLFDSR KRLEIDWPKR FDIIQGIARG 601: LLYLHHDSRL RVIHRDLKVS NILLDEKMNP KISDFGLARM YQGTEYQDNT RRVVGTLGYM SPEYAWTGMF SEKSDIYSFG VLMLEIISGE KISRFSYGVE 701: GKTLIAYAWE SWSEYRGIDL LDQDLADSCH PLEVGRCIQI GLLCVQHQPA DRPNTLELLA MLTTTSDLPS PKQPTFAFHT RDDESLSNDL ITVNGMTQSV 801: ILGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)