AT1G61490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, sperm cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61480.1); Has 122080 Blast hits to 120389 proteins in 4654 species: Archae - 108; Bacteria - 13580; Metazoa - 45068; Fungi - 10155; Plants - 34969; Viruses - 418; Other Eukaryotes - 17782 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22685154..22688267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89939.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 804 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKKRIVFFA CLLLFTVLLR FSYAGITTES PLSVEQTLSS SNGIYELGFF SPNNSQNLYV GIWFKGIIPR VVVWVANRET PTTDTSANLA ISSNGSLLLF 101: NGKHGVVWSI GENFASNGSR AELTDNGNLV VIDNASGRTL WESFEHFGDT MLPFSSLMYN LATGEKRVLT SWKTDTDPSP GVFVGQITPQ VPSQVLIMRG 201: STRYYRTGPW AKTRFTGIPL MDDTYASPFS LQQDANGSGF FTYFDRSFKL SRIIISSEGS MKRFRHNGTD WELSYMAPAN SCDIYGVCGP FGLCIVSVPL 301: KCKCLKGFVP HSTEEWKRGN WTGGCARLTE LHCQGNSTGK DVNIFHPVTN VKLPDFYEYE SSVDAEECHQ SCLHNCSCLA FAYIHGIGCL IWNQNLMDAV 401: QFSAGGEILS IRLAHSELGG NKRNKIIVAS TVSLSLFVIL TSAAFGFWRY RVKHKAYTLK DAWRNDLKSK EVPGLEFFEM NTIQTATNNF SLSNKLGQGG 501: FGSVYKGKLQ DGKEIAVKQL SSSSGQGKEE FMNEIVLISK LQHRNLVRVL GCCIEGEEKL LIYEFMLNKS LDTFVFDARK KLEVDWPKRF DIVQGIARGL 601: LYLHRDSRLK VIHRDLKVSN ILLDEKMNPK ISDFGLARMY EGTQCQDKTR RVVGTLGYMS PEYAWTGVFS EKSDIYSFGV LLLEIIIGEK ISRFSYGEEG 701: KTLLAYAWES WGETKGIDLL DQDLADSCRP LEVGRCVQIG LLCVQHQPAD RPNTLELLAM LTTTSDLPSP KQPTFVVHSR DDESSLSKDL FTVNEMTQSM 801: ILGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)