AT1G31860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : histidine biosynthesis bifunctional protein (HISIE) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a bifunctional protein that has phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase (PRA-PH) and phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase (PRA-CH) activities. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
AT-IE; FUNCTIONS IN: phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase activity, phosphoribosyl-ATP diphosphatase activity; INVOLVED IN: histidine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase (InterPro:IPR002496), Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase (InterPro:IPR008179), Phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase-like (InterPro:IPR021130); Has 8084 Blast hits to 8082 proteins in 2164 species: Archae - 247; Bacteria - 4946; Metazoa - 2; Fungi - 173; Plants - 52; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2664 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11434250..11436530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31669.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 281 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSYNALAQ SLARSSCFIP KPYSFRDTKL RSRSNVVFAC NDNKNIALQA KVDNLLDRIK WDDKGLAVAI AQNVDTGAVL MQGFVNREAL STTISSRKAT 101: FFSRSRSTLW TKGETSNNFI NILDVYVDCD RDSIIYLGTP DGPTCHTGEE TCYYTSVFDQ LNNDEASGNK LALTTLYSLE SIISKRKEES TVPQEGKPSW 201: TRRLLTDDAL LCSKIREEAD ELCRTLEDNE EVSRTPSEMA DVLYHAMVLL SKRGVKMEDV LEVLRKRFSQ SGIEEKQNRT K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)