AT1G23740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to cold; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Quinone oxidoreductase/zeta-crystallin, conserved site (InterPro:IPR002364), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein (TAIR:AT4G13010.1); Has 40144 Blast hits to 39997 proteins in 2741 species: Archae - 622; Bacteria - 25898; Metazoa - 1494; Fungi - 3833; Plants - 1284; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 7010 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8398245..8399656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40988.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 386 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNAALATTTA TTPVLRRETP LLHYCSLTTK SPVYQINRVR FGSCVQTVSK KFLKISASSQ SASAAVNVTA DASIPKEMKA WVYSDYGGVD VLKLESNIVV 101: PEIKEDQVLI KVVAAALNPV DAKRRQGKFK ATDSPLPTVP GYDVAGVVVK VGSAVKDLKE GDEVYANVSE KALEGPKQFG SLAEYTAVEE KLLALKPKNI 201: DFAQAAGLPL AIETADEGLV RTEFSAGKSI LVLNGAGGVG SLVIQLAKHV YGASKVAATA STEKLELVRS LGADLAIDYT KENIEDLPDK YDVVFDAIGM 301: CDKAVKVIKE GGKVVALTGA VTPPGFRFVV TSNGDVLKKL NPYIESGKVK PVVDPKGPFP FSRVADAFSY LETNHATGKV VVYPIP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)