AT5G14060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aspartate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
lysine-sensitive aspartate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CARAB-AK-LYS; FUNCTIONS IN: amino acid binding, aspartate kinase activity; INVOLVED IN: aspartate family amino acid biosynthetic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aspartate kinase, conserved site (InterPro:IPR018042), Aspartate/glutamate/uridylate kinase (InterPro:IPR001048), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912), Aspartate kinase domain (InterPro:IPR001341); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aspartate kinase 3 (TAIR:AT3G02020.1); Has 11053 Blast hits to 11025 proteins in 2540 species: Archae - 202; Bacteria - 7605; Metazoa - 4; Fungi - 146; Plants - 183; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2913 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:4536143..4538993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59608.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 544 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLQLYGVK TPGLALSSKR LEFASKGACF SVTLPSSSAV FRDVEHSCRN IGLRVSCEAL RVDLLQRKEP ETCDSSGTGK ELTCVMKFGG SSVESAERMK 101: EVANLILSFP DERPVIVLSA MGKTTNKLLK AGEKAVTCGV TNVESIEELS FIKELHLRTA HELGVETTVI EKHLEGLHQL LKGISMMKEL TLRTRDYLVS 201: FGECMSTRLF SAYLNKIGHK ARQYDAFEIG FITTDDFTNA DILEATYPAV SKTLVGDWSK ENAVPVVTGY LGKGWRSCAI TTLGRGGSDL TATTIGKALG 301: LREIQVWKDV DGVLTCDPNI YPGAQSVPYL TFDEAAELAY FGAQVLHPLS MRPARDGDIP VRVKNSYNPT APGTVITRSR DMSKAVLTSI VLKRNVTMLD 401: IASTRMLGQY GFLAKVFTTF EDLGISVDVV ATSEVSISLT LDPAKLWGRE LIQRVNELDN LVEELEKIAV VKLLQRRSII SLIGNVQKSS LILEKVFQVF 501: RSNGVNVQMI SQGASKVNIS LIVNDEEAEQ CVRALHSAFF ETDP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)