AT3G55040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione transferase lambda 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the lambda family of glutathione transferases. It has thiol transferase activity and self S-glutathionylation activity in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione transferase lambda 2 (GSTL2); INVOLVED IN: protein amino acid glutathionylation; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutathione S-transferase family protein (TAIR:AT5G02790.1); Has 2794 Blast hits to 2712 proteins in 545 species: Archae - 4; Bacteria - 768; Metazoa - 398; Fungi - 95; Plants - 1147; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 382 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20398718..20400305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33059.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 292 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVGLKVSAF LHPTLALSSR DVSLSSSSSS LYLDRKILRP GSGRRWCKSR RTEPILAVVE SSRVPELDSS SEPVQVFDGS TRLYISYTCP FAQRAWIARN 101: YKGLQNKIEL VPIDLKNRPA WYKEKVYSAN KVPALEHNNR VLGESLDLIK YIDTNFEGPS LTPDGLEKQV VADELLSYTD SFSKAVRSTL NGTDTNAADV 201: AFDYIEQALS KFNEGPFFLG QFSLVDVAYA PFIERFRLIL SDVMNVDITS GRPNLALWIQ EMNKIEAYTE TRQDPQELVE RYKRRVQAEA RL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)