AT2G38760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: cytosol,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : annexin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Annexins are calcium binding proteins that are localized in the cytoplasm. When cytosolic Ca2+ increases, they relocate to the plasma membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
annexin 3 (ANNAT3); FUNCTIONS IN: calcium-dependent phospholipid binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to salt stress, response to cold, response to heat; LOCATED IN: vacuole, cell surface; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Annexin like protein (InterPro:IPR015472), Annexin repeat (InterPro:IPR018502), Annexin repeat, conserved site (InterPro:IPR018252), Annexin (InterPro:IPR001464); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: annexin 8 (TAIR:AT5G12380.1); Has 3905 Blast hits to 2209 proteins in 203 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3079; Fungi - 145; Plants - 448; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 233 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16201086..16202490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36257.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATIRVPNEV PSPAQDSETL KQAIRGWGTD EKAIIRVLGQ RDQSQRRKIR ESFREIYGKD LIDVLSSELS GDFMKAVVSW TYDPAERDAR LVNKILNKEK 101: KKKSLENLKV IVEISCTTSP NHLIAVRKAY CSLFDSSLEE HIASSLPFPL AKLLVTLAST FRYDKDRTDA EVATIEAAML REAIEKKQLD HDHVLYILGT 201: RSIYQLRETF VAYKKNYGVT IDKDVDGCPG DADLRSLLKV AIFCIDTPEK HFAKVVRDSI EGFGTDEDSL TRAIVTRAEI DLMKVRGEYF NMYNTSMDNA 301: ITGDISGDYK DFIITLLGSK I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)