AT2G25880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ataurora2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of a family of Ser/Thr kinases whose activities peak during cell division. Transcripts are abundant in tissues rich in dividing cells like roots and flowers but are low or absent in fully expanded leaves and stems. In interphase cells, the protein is predominantly nuclear. During mitosis, the protein associates with plant-specific cytoskeletal structures (preprophase band, phragmoplast, nascent cell plate) that are necessary for cytokinesis as well as with the microtubule spindle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ataurora2 (AUR2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Spindle assembly checkpoint kinase (InterPro:IPR020663), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ataurora1 (TAIR:AT4G32830.1); Has 130749 Blast hits to 128519 proteins in 4314 species: Archae - 145; Bacteria - 15305; Metazoa - 47836; Fungi - 12919; Plants - 32506; Viruses - 547; Other Eukaryotes - 21491 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11034887..11036827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33312.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 288 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGISTETQQI AASEAAQKRW TTSDFDIGKP LGRGKFGHVY LAREKRSDHI VALKVLFKAQ LQQSQVEHQL RREVEIQSHL RHPNILRLYG YFYDQKRVYL 101: ILEYAVRGEL YKELQKCKYF SERRAATYVA SLARALIYCH GKHVIHRDIK PENLLIGAQG ELKIADFGWS VHTFNRRRTM CGTLDYLPPE MVESVEHDAS 201: VDIWSLGILC YEFLYGVPPF EAREHSETYK RIVQVDLKFP PKPIVSSSAK DLISQMLVKE STQRLALHKL LEHPWIVQNA DPSGLYRG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)