AT2G24850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.976 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : tyrosine aminotransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a tyrosine aminotransferase that is responsive to treatment with jasmonic acid. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
tyrosine aminotransferase 3 (TAT3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (InterPro:IPR001176), Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Tyrosine transaminase (InterPro:IPR021178), Tyrosine/nicotianamine aminotransferase (InterPro:IPR005958), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tyrosine transaminase family protein (TAIR:AT2G20610.1); Has 40308 Blast hits to 40304 proteins in 3024 species: Archae - 944; Bacteria - 29187; Metazoa - 746; Fungi - 752; Plants - 1298; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7381 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10583070..10585152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48821.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 445 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASNGVTNCN ANANVWRFKG NGATSDAAAV TLRKLAFGMF KNCTMNSGKT ILFPTPGEPS AHSNFRTCPE AEEAVAAAAR SGMANSYAPS PGVFKARRAV 101: AEYLNGELPT KLKAEDVYIT GGCNQAIEIV IDSLAGNPSA NILLPRPGYP HYDARAVYSG LEIRKYDLLP ESDWEINLDG LEAAADENTV AMVIINPNNP 201: CGNVYTYDHL NKVAEMARKL GIMIISDEVY DHVVYGDKPF IPMGKFASIA PVITLGSISK GWVNPGWRVG WIAMNDPNGI FVSTGVVQAI EDFLDLTPQP 301: SFILQEALPD ILEKTPKEFF EKKIKAMRRN VELSCERLKD IPCLFCPKKP ESCSYLWLKL DTSMLNNIKN DFDFCTKLVS EESLILIPGV ALGAENWVRI 401: SIGTDESVVQ EIFDRLKGFY DRHAISKEAI KLSGHAINQI VVSVN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)