AT1G78590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(H) kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a NADH kinase which can synthesize NADPH from NADH; also utilizes NAD+ as substrate although NADH is the preferred substrate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NAD(H) kinase 3 (NADK3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATP-NAD kinase, PpnK-type, alpha/beta (InterPro:IPR017438), ATP-NAD kinase, PpnK-type (InterPro:IPR016064), ATP-NAD/AcoX kinase (InterPro:IPR002504); Has 2859 Blast hits to 2859 proteins in 1070 species: Archae - 160; Bacteria - 1847; Metazoa - 99; Fungi - 31; Plants - 53; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 669 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29564343..29566128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34832.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIRKLLLLL KPIDPYPFLQ TEGASLIKNP QVLQYLESRC KVHKNAIKFC QEILSKKPVE WKPISRNDLS HPIRDVDMVI TVGGDGTLLH ASHFIDDSVP 101: VLGVNSDPTQ AHEVEELSDQ FDASRSTGHL CAATVENFEQ VLDDILFGRV VPAKVSRISL KLNSETLLSH ALNDILIAQP CPAAVSRFSF KIKNKDGASS 201: PKTVNCRSSG LRICTAAGST AAMQSAGGFV MPMLSRDLQF MVREPISPGS TASLMHSTFK PDQFMDVNWY SDHGTIYIDG CQVQHSVQLG DTIEISSDAP 301: VLNVFLSHGI SQIRSRY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)