AT1G06770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DREB2A-interacting protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a C3HC4 RING-domain-containing ubiquitin E3 ligase capable of interacting with DREB2A. The DRIP1-GFP fusion protein is nuclear-localized. DRIP1 seems to be involved in regulating stress-related transcriptional changes and drought tolerance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DREB2A-interacting protein 1 (DRIP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type, conserved site (InterPro:IPR017907), Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841), Zinc finger, C3HC4 RING-type (InterPro:IPR018957); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DREB2A-interacting protein 2 (TAIR:AT2G30580.1); Has 2055 Blast hits to 2008 proteins in 210 species: Archae - 0; Bacteria - 27; Metazoa - 1318; Fungi - 145; Plants - 309; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 254 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2079222..2081707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47330.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMIKVKKETM RACLSCSICD NILRDATTIS ECLHTFCRKC IYEKITEDEI ETCPVCNIDL GSTPLEKLRP DHNLQDLRAK IFALKRRKVK APGIVSLPGK 101: RKERSISSLV VSTPMVSAQA GTTRRRTKAP TRKELRNGSL AERTVKKEES SGDELLESTS SPDTLNKFTQ NKRQSKKSCK ESISNKENKD GDEPWDSKMD 201: WKPLNFLVEV ANGTKPLKSS ASQGSGSKSE HANVSRNQFQ GSKTKTKNKK RKCKREDDKS NNGDPTTSET VTPKRMRTTQ RKRSATTLGD SRNLPQPDES 301: SAKQERRNGP VWFSLVASND QEGGTSLPQI PANFLRIRDG NTTVSFIQKY LMRKLDLESE NEIEIKCMGE AVIPTLTLYN LVDLWLQKSS NHQRFAALVG 401: SSAKDFTMVL VYARKLPECN M |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)