AT1G02740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MRG family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MRG family protein; FUNCTIONS IN: chromatin binding; INVOLVED IN: chromatin assembly or disassembly; LOCATED IN: chromatin, nucleus; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histone H4 acetyltransferase, NuA4 complex, Eaf3/MRG15 subunit (InterPro:IPR017398), Tudor-like, plant (InterPro:IPR014002), MRG (InterPro:IPR008676), Chromo domain (InterPro:IPR000953); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MRG family protein (TAIR:AT4G37280.1); Has 1083 Blast hits to 947 proteins in 185 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 790; Fungi - 163; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 60 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:599734..602021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37630.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 327 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSPNAAAET DLTTDDFIGD TRRDSGSDTE TNTDCDGEDL PLLLLPAPPG HFEEGERVLA KHSDCFYEAK VLKVEFKDNE WKYFVHYIGW NKSWDEWIRL 101: DCLLKHSDEN IEKQKEQGLK QQGIKSAMAW KVSKMKPRSP NVARGRKRKQ DSVDTEKNVL PSDNLLSFNI PPALRKQLLD DFEFVTQMQK LVQLPRSPNV 201: DGILKKYIDS QMKKHGRVTD SLEEILKGLR CYFDKALPVM LLYNNERKQY EESVSGGVSP STVYGAEHLL RLFVKLPELL VHVNMAEETL KELQDNFVDI 301: LRFLRKNQSV LFVSTYKAVE EMEKKEG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)